A Saccharomyces Genome Database

Biocurator magában foglalja a közzétett szakirodalom vagy adathalmazok áttekintését, ami a legfontosabb eredmények azonosításához és absztrakciójához vezet. Az eredmény ezután beépül az adatbázisba, és ellenőrzött szókincseket használ a megfelelő génekhez vagy kromoszómális régiókhoz. Ahogy egyre több adatot rögzítenek, a biocuration egyre fontosabbá válik az orvosbiológiai kutatások szempontjából.

SGD tartsa referencia genomszekvencia A kezdő élesztő S. cerevisiae. Az SGD az S genomszekvenciájának forrása. cerevisiae s288c törzs háttér, magában foglalja a katalógus gének és kromoszóma jellemzője Genom.

az SGD egyik fontos funkciója az élesztő irodalom biokurálása. Az SGD biocurators az S. cerevisiae-re vonatkozó összes tudományos szakirodalmat megkeresi, elolvassa a dolgozatokat, és az adatbázis különböző meghatározott területein rögzíti főbb megállapításaikat.

az SGD biokurátorainak célja, hogy az egyes géneket az elsődleges irodalomból származó funkció(ok) azonosításával, valamint a gén ontológiájában a strukturált tudásreprezentáció felhasználásával összekapcsolják a kifejezésekkel. Ezenkívül a nagy áteresztőképességű kísérletekből azonosított funkciók, valamint a számítási szempontból előre jelzett funkciójegyzetek a GO Annotation projektből származnak.

a biokémiai útvonalakat az SGD manuálisan kurálja, és a Pathway Tools böngésző 15.0 (13) verziójával biztosítja. Az SGD biokémiai pathways adatkészlet az S. cerevisiae számára, amely az összes rendelkezésre álló Pathway Tools adatkészlet közül az egyik legjobban kurált adatkészlet, A kezdő élesztő arany standardja; az SGD támogatja az adatok frissítésére és javítására irányuló folyamatos erőfeszítéseket. A Pathway Tools interfész az egyes utak teljes leírását tartalmazza, molekuláris struktúrákkal, EC számokkal és teljes referencia listával. A frissített pathways böngésző számos továbbfejlesztett funkciót kínál, beleértve az útvonalban található gének listájának letöltését további elemzés céljából az SGD-n elérhető egyéb eszközökkel. Az útvonalböngésző hiperhivatkozása a Locus összefoglaló oldal ‘utak’ szakaszán keresztül történik. Az útvonal megjelenítése a http://pathway.yeastgenome.orgoldalon érhető el.

Vélemény, hozzászólás?

Az e-mail-címet nem tesszük közzé.